Le Département Administratif coordonne les services ci-après : finances, ressources Humaines, approvisionnement, maintenance et logistique. 

A. Les ressources humaines.

A pour mission de gérer le service du personnel et  les dossiers en vue d’identifier le personnel dans son ensemble : la discipline, La formation et La promotion du personnel. Le service compte 187 agents actuellement, parmi lesquels les médecins biologistes, les biologistes médicaux, les chimistes, les techniciens de laboratoire, les infirmiers, les ingénieurs en assainissement et environnement, les ingénieurs informaticiens, les vétérinaires, les administrateurs gestionnaires et d’autres administratifs.

B. Les Finances 

Le service s’occupe des finances, la comptabilité, la trésorerie et le budget de l’Institut. Il a pour mission d'enregistrer les dépenses et les recettes puis de fournir les tableaux de synthèses.

C. La Maintenance

 Ou autrement appelé Service Technique,le service assure la maintenance préventive, curative et palliative de chaque équipement de l'Institut. Les équipements envoyés dans les laboratoires, sont d’abord enregistrés par le service, puis inventoriés.  Le service procède au test d'utilisation de ses équipements avant de former les utilisateurs dans leurs différents départements et enfin, établir la fiche de vie de chaque équipement.